sample	chr	startpos	endpos	nMajor	nMinor
TCGA-BR-A4QI	1	61735	10741720	1	1
TCGA-BR-A4QI	1	10746809	12505205	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	12508967	15579492	1	1
TCGA-BR-A4QI	1	15581413	18235854	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	18236491	18905539	1	1
TCGA-BR-A4QI	1	18910077	21096482	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	21100284	32565141	1	1
TCGA-BR-A4QI	1	32566811	33852923	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	33853189	38385325	1	1
TCGA-BR-A4QI	1	38386001	40600072	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	40601637	64549569	1	1
TCGA-BR-A4QI	1	64552557	67032195	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	67037983	67503042	1	1
TCGA-BR-A4QI	1	67503934	68099527	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	68099829	83160285	1	1
TCGA-BR-A4QI	1	83160311	84388931	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	84389972	121741181	1	1
TCGA-BR-A4QI	1	143285278	151437367	2	2
TCGA-BR-A4QI	1	151437510	153198672	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	153198707	154847591	4	1
TCGA-BR-A4QI	1	154849733	163047951	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	163048715	165056485	2	2
TCGA-BR-A4QI	1	165056521	182367112	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	182367704	184779079	4	1
TCGA-BR-A4QI	1	184780211	186347356	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	186347600	186906795	2	0
TCGA-BR-A4QI	1	186908079	200782987	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	200790806	202328980	3	1
TCGA-BR-A4QI	1	202329333	210756119	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	210756551	211237784	4	1
TCGA-BR-A4QI	1	211242608	219092257	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	219096456	224301845	2	2
TCGA-BR-A4QI	1	224304046	225688361	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	225692293	225842623	4	1
TCGA-BR-A4QI	1	225844351	229042572	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	229042611	229462213	4	1
TCGA-BR-A4QI	1	229468942	233474414	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	233474653	234063775	5	1
TCGA-BR-A4QI	1	234064180	244900185	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	244904109	245322783	4	1
TCGA-BR-A4QI	1	245322929	246577803	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	246581116	248930189	3	1
TCGA-BR-A4QI	2	12784	8346529	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	8346924	10651342	4	1
TCGA-BR-A4QI	2	10651629	12738542	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	12741652	15005830	6	2
TCGA-BR-A4QI	2	15006342	21259420	3	2
TCGA-BR-A4QI	2	21260683	23185769	3	3
TCGA-BR-A4QI	2	23186991	26730130	3	2
TCGA-BR-A4QI	2	26730672	30154189	4	2
TCGA-BR-A4QI	2	30154668	32298100	3	2
TCGA-BR-A4QI	2	32300777	33268266	9	2
TCGA-BR-A4QI	2	33268431	35428409	3	2
TCGA-BR-A4QI	2	35428656	36965723	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	36976367	37225125	5	1
TCGA-BR-A4QI	2	37231212	44973522	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	44973761	47019760	4	1
TCGA-BR-A4QI	2	47021057	47219749	6	1
TCGA-BR-A4QI	2	47222463	49505256	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	49507695	56751242	2	2
TCGA-BR-A4QI	2	56751429	63403125	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	63403702	63985838	5	1
TCGA-BR-A4QI	2	63986537	73602245	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	73603947	74865434	5	1
TCGA-BR-A4QI	2	74865647	85670796	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	85671020	87696853	4	1
TCGA-BR-A4QI	2	87725148	114354751	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	114354966	117686707	2	2
TCGA-BR-A4QI	2	117686739	159571890	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	159573616	161821085	2	2
TCGA-BR-A4QI	2	161821952	164468022	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	164472594	165963251	5	1
TCGA-BR-A4QI	2	165977626	168171029	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	168171045	170468864	2	2
TCGA-BR-A4QI	2	170469811	175708041	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	175715064	176221565	4	1
TCGA-BR-A4QI	2	176222292	182439876	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	182440050	185820007	2	2
TCGA-BR-A4QI	2	185824832	199784468	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	199786385	201608355	4	1
TCGA-BR-A4QI	2	201616808	214421519	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	214422448	216042649	4	1
TCGA-BR-A4QI	2	216043956	226550839	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	226551278	226694698	4	1
TCGA-BR-A4QI	2	226697423	235556430	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	235562218	235801344	5	1
TCGA-BR-A4QI	2	235803276	238203962	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	238204462	238533346	4	1
TCGA-BR-A4QI	2	238536977	242147305	2	1
TCGA-BR-A4QI	3	18667	11013652	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	11013938	12148468	3	0
TCGA-BR-A4QI	3	12150894	12453295	6	0
TCGA-BR-A4QI	3	12456902	13853690	3	0
TCGA-BR-A4QI	3	13854309	15548084	4	0
TCGA-BR-A4QI	3	15548925	26019895	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	26020962	27741182	5	0
TCGA-BR-A4QI	3	27741598	37019323	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	37021363	37318450	4	0
TCGA-BR-A4QI	3	37326842	48935270	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	48935459	52275363	4	0
TCGA-BR-A4QI	3	52286896	56457266	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	56466107	58246803	4	0
TCGA-BR-A4QI	3	58246891	62944017	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	62947769	63314701	5	0
TCGA-BR-A4QI	3	63321143	71763195	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	71767278	72687917	4	0
TCGA-BR-A4QI	3	72689009	82931943	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	82932937	83857317	4	0
TCGA-BR-A4QI	3	83857862	98238141	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	98238271	99346452	4	0
TCGA-BR-A4QI	3	99351760	107457531	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	107458976	108422156	4	0
TCGA-BR-A4QI	3	108422693	132668933	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	132680938	133792507	4	0
TCGA-BR-A4QI	3	133793215	137549385	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	137554278	138473432	4	0
TCGA-BR-A4QI	3	138474402	139125004	9	0
TCGA-BR-A4QI	3	139127441	154364223	5	0
TCGA-BR-A4QI	3	154365026	157596419	7	0
TCGA-BR-A4QI	3	157597124	166775379	5	0
TCGA-BR-A4QI	3	166775494	166955313	11	0
TCGA-BR-A4QI	3	166959051	169640726	5	0
TCGA-BR-A4QI	3	169647757	171338070	9	0
TCGA-BR-A4QI	3	171338367	178435900	5	0
TCGA-BR-A4QI	3	178437247	178644855	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	178647675	178762916	4	0
TCGA-BR-A4QI	3	178764234	198169247	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	12281	9376553	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	9379218	10451901	4	0
TCGA-BR-A4QI	4	10453370	60902228	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	60903760	62247817	5	0
TCGA-BR-A4QI	4	62252735	79863841	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	79867628	80136306	5	0
TCGA-BR-A4QI	4	80139682	96541643	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	96541950	97114387	5	0
TCGA-BR-A4QI	4	97120118	111720582	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	111723564	111985061	5	0
TCGA-BR-A4QI	4	111987141	120235445	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	120238929	121887528	4	0
TCGA-BR-A4QI	4	121887883	123100262	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	123100471	123685815	4	0
TCGA-BR-A4QI	4	123686046	142304001	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	142307351	144252153	5	0
TCGA-BR-A4QI	4	144259604	150746994	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	150752611	151646758	4	0
TCGA-BR-A4QI	4	151651843	159770908	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	159771136	161881952	3	0
TCGA-BR-A4QI	4	161882274	180640982	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	180641476	180827851	5	0
TCGA-BR-A4QI	4	180828004	190106768	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	15532	1479563	4	0
TCGA-BR-A4QI	5	1487548	1825933	9	0
TCGA-BR-A4QI	5	1825961	2684025	5	0
TCGA-BR-A4QI	5	2685453	16423353	4	0
TCGA-BR-A4QI	5	16426274	16656461	7	0
TCGA-BR-A4QI	5	16656694	18241107	5	0
TCGA-BR-A4QI	5	18248377	18404720	11	0
TCGA-BR-A4QI	5	18405635	21649717	5	0
TCGA-BR-A4QI	5	21653918	22311877	16	0
TCGA-BR-A4QI	5	22314191	30931732	8	0
TCGA-BR-A4QI	5	30932238	32592630	7	0
TCGA-BR-A4QI	5	32592855	32820164	13	0
TCGA-BR-A4QI	5	32821196	35481545	7	0
TCGA-BR-A4QI	5	35482212	36373402	9	0
TCGA-BR-A4QI	5	36373654	37941885	15	0
TCGA-BR-A4QI	5	37944427	40516541	7	0
TCGA-BR-A4QI	5	40517229	50291967	6	0
TCGA-BR-A4QI	5	50292898	64307713	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	64307983	67907962	3	0
TCGA-BR-A4QI	5	67907962	68404160	5	0
TCGA-BR-A4QI	5	68406552	73050693	3	0
TCGA-BR-A4QI	5	73051243	75688794	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	75689785	75893473	10	0
TCGA-BR-A4QI	5	75895867	141190899	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	141191605	142780930	3	0
TCGA-BR-A4QI	5	142783068	144314564	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	144316464	144604546	5	0
TCGA-BR-A4QI	5	144607435	148042447	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	148047935	150911089	4	0
TCGA-BR-A4QI	5	150916915	153405498	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	153406312	153561531	4	0
TCGA-BR-A4QI	5	153568694	153734183	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	153734399	154873213	4	0
TCGA-BR-A4QI	5	154875258	162738281	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	162738565	162890228	5	0
TCGA-BR-A4QI	5	162893473	163440189	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	163442209	165680095	5	0
TCGA-BR-A4QI	5	165680122	173255950	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	173255982	174116838	4	0
TCGA-BR-A4QI	5	174118599	177090731	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	177090745	178970803	4	0
TCGA-BR-A4QI	5	178975406	181363319	2	0
TCGA-BR-A4QI	6	149661	2453317	2	1
TCGA-BR-A4QI	6	2454895	3415213	3	2
TCGA-BR-A4QI	6	3416372	3616529	5	1
TCGA-BR-A4QI	6	3622517	24545026	2	1
TCGA-BR-A4QI	6	24545079	26157851	2	2
TCGA-BR-A4QI	6	26158765	27888502	2	1
TCGA-BR-A4QI	6	27890643	28913883	10	2
TCGA-BR-A4QI	6	28925142	30097798	2	2
TCGA-BR-A4QI	6	30098254	31194743	4	2
TCGA-BR-A4QI	6	31195186	39856791	2	2
TCGA-BR-A4QI	6	39860028	40302002	4	2
TCGA-BR-A4QI	6	40302308	41977812	7	2
TCGA-BR-A4QI	6	41978878	42242538	12	1
TCGA-BR-A4QI	6	42242652	44285654	6	2
TCGA-BR-A4QI	6	44286012	47727266	3	2
TCGA-BR-A4QI	6	47727376	51645194	3	3
TCGA-BR-A4QI	6	51647512	56035410	3	2
TCGA-BR-A4QI	6	56040343	57977452	8	2
TCGA-BR-A4QI	6	57978895	60889330	4	3
TCGA-BR-A4QI	6	60890356	61783402	2	2
TCGA-BR-A4QI	6	61783960	63296564	5	1
TCGA-BR-A4QI	6	63297892	63886080	6	1
TCGA-BR-A4QI	6	63893441	85323314	2	1
TCGA-BR-A4QI	6	85324818	90061482	2	2
TCGA-BR-A4QI	6	90062077	90745765	4	1
TCGA-BR-A4QI	6	90751626	124776158	2	1
TCGA-BR-A4QI	6	124776281	126440381	3	2
TCGA-BR-A4QI	6	126443044	127743231	2	1
TCGA-BR-A4QI	6	127744070	128486931	4	1
TCGA-BR-A4QI	6	128489913	130556549	3	3
TCGA-BR-A4QI	6	130556895	130827286	7	2
TCGA-BR-A4QI	6	130827723	131968073	3	3
TCGA-BR-A4QI	6	131968284	133569019	5	2
TCGA-BR-A4QI	6	133569057	134923741	6	2
TCGA-BR-A4QI	6	134925156	135423878	10	2
TCGA-BR-A4QI	6	135431470	143090625	5	2
TCGA-BR-A4QI	6	143093658	156876109	2	0
TCGA-BR-A4QI	6	156876335	158698779	3	0
TCGA-BR-A4QI	6	158698947	159066359	6	0
TCGA-BR-A4QI	6	159066423	163434033	3	0
TCGA-BR-A4QI	6	163435750	164875544	7	0
TCGA-BR-A4QI	6	164875972	170741917	3	0
TCGA-BR-A4QI	7	43259	2786288	3	2
TCGA-BR-A4QI	7	2786810	11751018	3	3
TCGA-BR-A4QI	7	11752148	11802155	3	0
TCGA-BR-A4QI	7	11802175	19535882	3	3
TCGA-BR-A4QI	7	19535932	20917963	4	4
TCGA-BR-A4QI	7	20922092	32632910	3	2
TCGA-BR-A4QI	7	32634538	33099263	5	4
TCGA-BR-A4QI	7	33099535	52162170	3	3
TCGA-BR-A4QI	7	52162584	54347038	4	3
TCGA-BR-A4QI	7	54347132	63811553	3	3
TCGA-BR-A4QI	7	63813150	66451931	2	1
TCGA-BR-A4QI	7	66454661	68458508	5	1
TCGA-BR-A4QI	7	68459446	77937413	2	1
TCGA-BR-A4QI	7	77942717	86605569	1	1
TCGA-BR-A4QI	7	86605772	92860726	2	1
TCGA-BR-A4QI	7	92860778	94638954	3	2
TCGA-BR-A4QI	7	94642122	99536059	2	1
TCGA-BR-A4QI	7	99539565	101136024	3	3
TCGA-BR-A4QI	7	101136590	104417008	2	2
TCGA-BR-A4QI	7	104417447	111999887	2	0
TCGA-BR-A4QI	7	112001521	114233052	6	0
TCGA-BR-A4QI	7	114236531	115923493	2	0
TCGA-BR-A4QI	7	115923493	117593353	4	0
TCGA-BR-A4QI	7	117594122	128316858	2	0
TCGA-BR-A4QI	7	128317267	131842082	4	0
TCGA-BR-A4QI	7	131842251	143094952	2	0
TCGA-BR-A4QI	7	143095565	155749714	1	0
TCGA-BR-A4QI	7	155751112	159034349	3	0
TCGA-BR-A4QI	7	159034635	159334314	1	0
TCGA-BR-A4QI	8	81254	27691904	1	0
TCGA-BR-A4QI	8	27693556	27951870	2	0
TCGA-BR-A4QI	8	27952483	30361594	3	0
TCGA-BR-A4QI	8	30362293	31268860	2	0
TCGA-BR-A4QI	8	31268926	38959894	1	0
TCGA-BR-A4QI	8	38964147	39667031	10	1
TCGA-BR-A4QI	8	39670693	41146854	4	1
TCGA-BR-A4QI	8	41147916	43841613	4	2
TCGA-BR-A4QI	8	43845969	51156928	4	0
TCGA-BR-A4QI	8	51160431	56387027	4	2
TCGA-BR-A4QI	8	56387138	56747085	5	4
TCGA-BR-A4QI	8	56747132	59421512	5	2
TCGA-BR-A4QI	8	59423731	60947875	11	2
TCGA-BR-A4QI	8	60948037	63458845	6	2
TCGA-BR-A4QI	8	63474549	75316060	5	2
TCGA-BR-A4QI	8	75317624	76749798	8	2
TCGA-BR-A4QI	8	76752828	77720658	4	3
TCGA-BR-A4QI	8	77721656	87794943	3	2
TCGA-BR-A4QI	8	87799526	88157551	5	2
TCGA-BR-A4QI	8	88157848	99764715	2	2
TCGA-BR-A4QI	8	99765660	101406923	5	2
TCGA-BR-A4QI	8	101409501	121749578	3	2
TCGA-BR-A4QI	8	121750698	122282756	6	2
TCGA-BR-A4QI	8	122285104	125316270	4	2
TCGA-BR-A4QI	8	125316453	134664596	2	2
TCGA-BR-A4QI	8	134666561	134874380	4	2
TCGA-BR-A4QI	8	134876702	137731935	3	2
TCGA-BR-A4QI	8	137733061	137921697	5	3
TCGA-BR-A4QI	8	137922319	140437435	3	2
TCGA-BR-A4QI	8	140447102	141679215	4	2
TCGA-BR-A4QI	8	141679704	143695072	6	2
TCGA-BR-A4QI	8	143695297	145072769	3	2
TCGA-BR-A4QI	9	46587	2700991	2	2
TCGA-BR-A4QI	9	2701429	4206571	2	0
TCGA-BR-A4QI	9	4206671	6756149	3	0
TCGA-BR-A4QI	9	6760217	13832492	2	0
TCGA-BR-A4QI	9	13832588	15374611	4	0
TCGA-BR-A4QI	9	15378194	25592658	2	0
TCGA-BR-A4QI	9	25597967	26027348	9	2
TCGA-BR-A4QI	9	26030588	26205606	3	3
TCGA-BR-A4QI	9	26205696	36210414	2	2
TCGA-BR-A4QI	9	36212443	36712497	5	2
TCGA-BR-A4QI	9	36714255	67770059	2	1
TCGA-BR-A4QI	9	67832331	70941666	1	0
TCGA-BR-A4QI	9	70941763	101664532	2	1
TCGA-BR-A4QI	9	101664982	104035454	2	2
TCGA-BR-A4QI	9	104036026	113391819	2	1
TCGA-BR-A4QI	9	113397143	115072561	5	1
TCGA-BR-A4QI	9	115072662	115307980	2	1
TCGA-BR-A4QI	9	115311097	115462020	5	1
TCGA-BR-A4QI	9	115466219	127792719	2	1
TCGA-BR-A4QI	9	127796396	129776655	2	2
TCGA-BR-A4QI	9	129777710	134542953	2	1
TCGA-BR-A4QI	9	134543751	136811224	2	2
TCGA-BR-A4QI	9	136817006	138200944	2	1
TCGA-BR-A4QI	10	26823	5403995	4	1
TCGA-BR-A4QI	10	5404831	5805720	8	1
TCGA-BR-A4QI	10	5806038	10775959	4	1
TCGA-BR-A4QI	10	10776124	10948658	8	1
TCGA-BR-A4QI	10	10950858	21069328	4	1
TCGA-BR-A4QI	10	21071771	21579946	8	1
TCGA-BR-A4QI	10	21585597	24549362	4	1
TCGA-BR-A4QI	10	24549362	25326678	4	4
TCGA-BR-A4QI	10	25332029	31799484	4	1
TCGA-BR-A4QI	10	31802957	32557509	9	1
TCGA-BR-A4QI	10	32570564	41738273	5	1
TCGA-BR-A4QI	10	41755252	51831252	2	1
TCGA-BR-A4QI	10	51831474	54268875	1	1
TCGA-BR-A4QI	10	54273817	54437431	2	1
TCGA-BR-A4QI	10	54438143	60436578	1	1
TCGA-BR-A4QI	10	60437098	60815454	2	1
TCGA-BR-A4QI	10	60815547	61981154	3	3
TCGA-BR-A4QI	10	61984850	64520082	2	1
TCGA-BR-A4QI	10	64521742	67198355	1	1
TCGA-BR-A4QI	10	67198808	69465778	2	1
TCGA-BR-A4QI	10	69466688	71607598	1	1
TCGA-BR-A4QI	10	71609880	76059272	2	1
TCGA-BR-A4QI	10	76059442	94207098	1	1
TCGA-BR-A4QI	10	94210156	96201738	2	1
TCGA-BR-A4QI	10	96202931	116397067	1	1
TCGA-BR-A4QI	10	116400531	117490629	2	1
TCGA-BR-A4QI	10	117490700	122214331	1	1
TCGA-BR-A4QI	10	122214913	126925049	2	1
TCGA-BR-A4QI	10	126925782	127769184	1	1
TCGA-BR-A4QI	10	127770935	128036931	4	1
TCGA-BR-A4QI	10	128037664	133769379	1	1
TCGA-BR-A4QI	11	198572	12774115	3	0
TCGA-BR-A4QI	11	12774978	15109097	4	0
TCGA-BR-A4QI	11	15111132	15347502	3	0
TCGA-BR-A4QI	11	15351248	16027906	6	0
TCGA-BR-A4QI	11	16033367	16756975	3	0
TCGA-BR-A4QI	11	16757240	18949201	5	0
TCGA-BR-A4QI	11	18949628	26499740	3	0
TCGA-BR-A4QI	11	26499948	27032045	4	0
TCGA-BR-A4QI	11	27037558	28270035	7	0
TCGA-BR-A4QI	11	28270531	29158263	9	0
TCGA-BR-A4QI	11	29158411	34331523	3	0
TCGA-BR-A4QI	11	34331679	42714332	4	0
TCGA-BR-A4QI	11	42716758	46540552	2	0
TCGA-BR-A4QI	11	46546759	57097941	4	0
TCGA-BR-A4QI	11	57098094	68937715	3	0
TCGA-BR-A4QI	11	68943379	70006134	5	0
TCGA-BR-A4QI	11	70008612	77624191	3	0
TCGA-BR-A4QI	11	77624291	78191543	5	0
TCGA-BR-A4QI	11	78192052	86900124	3	0
TCGA-BR-A4QI	11	86901540	88343687	2	0
TCGA-BR-A4QI	11	88347065	91232984	1	0
TCGA-BR-A4QI	11	91233648	108550436	2	0
TCGA-BR-A4QI	11	108553769	108875147	4	0
TCGA-BR-A4QI	11	108875761	115933690	2	0
TCGA-BR-A4QI	11	115936571	119015407	3	0
TCGA-BR-A4QI	11	119016211	127047241	2	0
TCGA-BR-A4QI	11	127047485	132962978	3	0
TCGA-BR-A4QI	11	132967793	134151903	2	0
TCGA-BR-A4QI	11	134152128	135074876	1	0
TCGA-BR-A4QI	12	51460	308467	2	0
TCGA-BR-A4QI	12	308525	1445796	2	1
TCGA-BR-A4QI	12	1453523	2950457	4	1
TCGA-BR-A4QI	12	2954929	13739474	2	1
TCGA-BR-A4QI	12	13739589	14109321	2	2
TCGA-BR-A4QI	12	14109611	14939635	3	3
TCGA-BR-A4QI	12	14940519	29672684	2	1
TCGA-BR-A4QI	12	29673315	30286396	5	1
TCGA-BR-A4QI	12	30294175	32204590	2	1
TCGA-BR-A4QI	12	32205303	32920869	4	1
TCGA-BR-A4QI	12	32920919	39027965	2	1
TCGA-BR-A4QI	12	39033352	46345926	1	1
TCGA-BR-A4QI	12	46348952	48241932	2	1
TCGA-BR-A4QI	12	48243579	53065317	1	1
TCGA-BR-A4QI	12	53066097	55137316	2	1
TCGA-BR-A4QI	12	55142885	55447038	4	1
TCGA-BR-A4QI	12	55450388	55583361	9	1
TCGA-BR-A4QI	12	55596314	56371722	4	1
TCGA-BR-A4QI	12	56374488	61987461	1	1
TCGA-BR-A4QI	12	61993994	62228204	2	1
TCGA-BR-A4QI	12	62233655	77735107	1	1
TCGA-BR-A4QI	12	77736097	80086962	2	1
TCGA-BR-A4QI	12	80088205	87702396	1	1
TCGA-BR-A4QI	12	87702659	87966768	2	1
TCGA-BR-A4QI	12	87968615	106350707	1	1
TCGA-BR-A4QI	12	106357851	118080674	3	1
TCGA-BR-A4QI	12	118081611	118878894	7	1
TCGA-BR-A4QI	12	118879391	124510932	3	1
TCGA-BR-A4QI	12	124511674	124803102	4	1
TCGA-BR-A4QI	12	124804719	125030171	8	1
TCGA-BR-A4QI	12	125031286	126822557	3	1
TCGA-BR-A4QI	12	126823105	127168282	3	3
TCGA-BR-A4QI	12	127168655	131922114	3	1
TCGA-BR-A4QI	12	131922657	132206323	6	1
TCGA-BR-A4QI	12	132208942	133201603	3	1
TCGA-BR-A4QI	13	18452809	25205427	2	2
TCGA-BR-A4QI	13	25205799	26010984	3	2
TCGA-BR-A4QI	13	26011086	26223384	6	2
TCGA-BR-A4QI	13	26223981	29410800	3	2
TCGA-BR-A4QI	13	29411346	32349474	3	0
TCGA-BR-A4QI	13	32349553	32559910	6	0
TCGA-BR-A4QI	13	32560805	33026095	3	0
TCGA-BR-A4QI	13	33026139	33125269	6	0
TCGA-BR-A4QI	13	33125518	48663908	3	0
TCGA-BR-A4QI	13	48665168	50825817	6	0
TCGA-BR-A4QI	13	50827857	76802496	3	0
TCGA-BR-A4QI	13	76806570	76982190	5	0
TCGA-BR-A4QI	13	76982959	102578104	3	0
TCGA-BR-A4QI	13	102580992	102776818	7	0
TCGA-BR-A4QI	13	102777130	114342922	3	0
TCGA-BR-A4QI	14	18225647	21359886	2	2
TCGA-BR-A4QI	14	21359914	29354620	2	1
TCGA-BR-A4QI	14	29354925	29444961	5	1
TCGA-BR-A4QI	14	29445897	31806931	2	1
TCGA-BR-A4QI	14	31810753	33128675	3	1
TCGA-BR-A4QI	14	33129662	36650049	6	1
TCGA-BR-A4QI	14	36650687	37579902	7	1
TCGA-BR-A4QI	14	37582706	39316379	3	2
TCGA-BR-A4QI	14	39316955	49258235	3	1
TCGA-BR-A4QI	14	49259397	50975912	7	1
TCGA-BR-A4QI	14	50975952	64229671	3	1
TCGA-BR-A4QI	14	64229703	64653121	6	0
TCGA-BR-A4QI	14	64654384	66726735	3	1
TCGA-BR-A4QI	14	66731017	68890458	3	2
TCGA-BR-A4QI	14	68890548	70336380	3	1
TCGA-BR-A4QI	14	70336923	71756016	3	2
TCGA-BR-A4QI	14	71757755	73950133	3	1
TCGA-BR-A4QI	14	73953737	76603210	6	1
TCGA-BR-A4QI	14	76605065	77673572	4	1
TCGA-BR-A4QI	14	77679187	85279620	2	1
TCGA-BR-A4QI	14	85279972	86523484	3	2
TCGA-BR-A4QI	14	86525793	91553439	2	1
TCGA-BR-A4QI	14	91553453	91923028	4	1
TCGA-BR-A4QI	14	91923085	98322766	2	1
TCGA-BR-A4QI	14	98324770	98473264	4	1
TCGA-BR-A4QI	14	98473639	106877229	2	1
TCGA-BR-A4QI	15	19811075	32478259	1	0
TCGA-BR-A4QI	15	32484010	34098010	2	0
TCGA-BR-A4QI	15	34105312	43108561	1	0
TCGA-BR-A4QI	15	43110192	44808654	2	1
TCGA-BR-A4QI	15	44813176	45281291	5	2
TCGA-BR-A4QI	15	45282390	45360691	5	3
TCGA-BR-A4QI	15	45366784	47678351	3	1
TCGA-BR-A4QI	15	47679254	74589474	1	1
TCGA-BR-A4QI	15	74590627	78202002	2	1
TCGA-BR-A4QI	15	78209629	87599982	1	1
TCGA-BR-A4QI	15	87600416	88242607	4	1
TCGA-BR-A4QI	15	88243598	90792532	6	1
TCGA-BR-A4QI	15	90796185	92079718	3	2
TCGA-BR-A4QI	15	92079782	92271322	5	1
TCGA-BR-A4QI	15	92271373	92934950	3	1
TCGA-BR-A4QI	15	92936568	93137856	8	1
TCGA-BR-A4QI	15	93138122	96367211	4	1
TCGA-BR-A4QI	15	96370207	96555924	9	1
TCGA-BR-A4QI	15	96557865	97753246	5	1
TCGA-BR-A4QI	15	97753511	101928837	2	1
TCGA-BR-A4QI	16	10777	5535851	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	5536593	6181717	3	0
TCGA-BR-A4QI	16	6181875	6713454	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	6713749	7488650	3	0
TCGA-BR-A4QI	16	7489450	10536136	1	0
TCGA-BR-A4QI	16	10538055	11063429	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	11065315	12238825	4	0
TCGA-BR-A4QI	16	12239032	12575538	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	12576731	12940770	4	0
TCGA-BR-A4QI	16	12940976	13086530	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	13090959	13162017	6	0
TCGA-BR-A4QI	16	13167601	13249378	5	0
TCGA-BR-A4QI	16	13249415	13508799	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	13513711	13813032	5	0
TCGA-BR-A4QI	16	13820205	14548948	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	14553011	18631895	3	0
TCGA-BR-A4QI	16	18654518	23226160	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	23228587	25258671	3	0
TCGA-BR-A4QI	16	25258952	26631901	5	0
TCGA-BR-A4QI	16	26632628	36048855	3	0
TCGA-BR-A4QI	16	46429870	60292057	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	60294446	62657840	0	0
TCGA-BR-A4QI	16	62663236	66085273	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	66085918	68342929	6	0
TCGA-BR-A4QI	16	68343553	78309841	4	0
TCGA-BR-A4QI	16	78310039	78514677	7	0
TCGA-BR-A4QI	16	78514759	83879361	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	83884222	84064783	4	0
TCGA-BR-A4QI	16	84065010	89334521	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	89335826	90221127	3	0
TCGA-BR-A4QI	17	150733	2274860	3	0
TCGA-BR-A4QI	17	2277468	15968760	4	0
TCGA-BR-A4QI	17	15969661	18109461	6	0
TCGA-BR-A4QI	17	18110489	26949301	4	0
TCGA-BR-A4QI	17	26955079	27077635	0	0
TCGA-BR-A4QI	17	27082500	30252252	3	0
TCGA-BR-A4QI	17	30252302	30779746	4	0
TCGA-BR-A4QI	17	30780690	33327665	2	0
TCGA-BR-A4QI	17	33328771	33954786	4	2
TCGA-BR-A4QI	17	33956774	34542363	2	0
TCGA-BR-A4QI	17	34544556	34633281	4	2
TCGA-BR-A4QI	17	34639704	35475137	2	0
TCGA-BR-A4QI	17	35475384	35687188	5	1
TCGA-BR-A4QI	17	35688078	37147226	2	0
TCGA-BR-A4QI	17	37155061	37743574	3	2
TCGA-BR-A4QI	17	37743881	39517450	3	3
TCGA-BR-A4QI	17	39526404	39873085	8	2
TCGA-BR-A4QI	17	39875096	43597220	4	4
TCGA-BR-A4QI	17	43598077	44725634	2	2
TCGA-BR-A4QI	17	44728507	45106052	4	3
TCGA-BR-A4QI	17	45108452	47888600	3	0
TCGA-BR-A4QI	17	47892239	49397645	2	0
TCGA-BR-A4QI	17	49399784	52800429	4	0
TCGA-BR-A4QI	17	52800429	56210317	2	0
TCGA-BR-A4QI	17	56211405	57088071	3	0
TCGA-BR-A4QI	17	57088251	63088725	2	0
TCGA-BR-A4QI	17	63090190	65745527	4	0
TCGA-BR-A4QI	17	65745929	78135054	2	0
TCGA-BR-A4QI	17	78136178	80049923	8	0
TCGA-BR-A4QI	17	80053096	80256944	4	0
TCGA-BR-A4QI	17	80264419	83090856	2	0
TCGA-BR-A4QI	18	48133	2316090	2	1
TCGA-BR-A4QI	18	2316586	4928572	2	2
TCGA-BR-A4QI	18	4928711	23530314	2	1
TCGA-BR-A4QI	18	23532810	26913045	2	2
TCGA-BR-A4QI	18	26913089	27691230	6	1
TCGA-BR-A4QI	18	27693409	39057262	2	0
TCGA-BR-A4QI	18	39058944	39340684	4	0
TCGA-BR-A4QI	18	39340772	64080161	2	0
TCGA-BR-A4QI	18	64080594	65960310	4	0
TCGA-BR-A4QI	18	65961206	80257174	2	0
TCGA-BR-A4QI	19	90910	575083	2	2
TCGA-BR-A4QI	19	579100	2114285	3	2
TCGA-BR-A4QI	19	2123040	2538715	5	1
TCGA-BR-A4QI	19	2546170	3134701	3	2
TCGA-BR-A4QI	19	3143285	12742851	2	2
TCGA-BR-A4QI	19	12744285	13575448	4	2
TCGA-BR-A4QI	19	13579818	31564666	2	2
TCGA-BR-A4QI	19	31567987	32874524	2	1
TCGA-BR-A4QI	19	32874867	33078594	2	0
TCGA-BR-A4QI	19	33079357	34092296	8	1
TCGA-BR-A4QI	19	34092753	35993830	6	1
TCGA-BR-A4QI	19	35999075	43898741	1	0
TCGA-BR-A4QI	19	43903591	44109024	4	0
TCGA-BR-A4QI	19	44109290	44137900	8	2
TCGA-BR-A4QI	19	44138028	46351452	11	1
TCGA-BR-A4QI	19	46356801	46790074	6	0
TCGA-BR-A4QI	19	46796562	46874047	2	1
TCGA-BR-A4QI	19	46876296	51297087	1	1
TCGA-BR-A4QI	19	51298362	58586487	2	1
TCGA-BR-A4QI	20	80664	17864882	2	0
TCGA-BR-A4QI	20	17865742	19318746	2	2
TCGA-BR-A4QI	20	19319504	21239048	4	2
TCGA-BR-A4QI	20	21239574	37888049	2	2
TCGA-BR-A4QI	20	37890001	40764916	4	2
TCGA-BR-A4QI	20	40766570	56162480	2	2
TCGA-BR-A4QI	20	56162624	57157707	4	2
TCGA-BR-A4QI	20	57157845	58288381	4	4
TCGA-BR-A4QI	20	58288413	58685864	4	2
TCGA-BR-A4QI	20	58688592	60436575	2	2
TCGA-BR-A4QI	20	60437251	62287334	4	2
TCGA-BR-A4QI	20	62292725	64324800	2	2
TCGA-BR-A4QI	21	10336543	14076239	1	0
TCGA-BR-A4QI	21	14076278	20491253	0	0
TCGA-BR-A4QI	21	20494074	32132779	2	0
TCGA-BR-A4QI	21	32133687	32498095	4	0
TCGA-BR-A4QI	21	32500776	34436691	2	0
TCGA-BR-A4QI	21	34440329	35796891	4	3
TCGA-BR-A4QI	21	35797083	36502677	6	3
TCGA-BR-A4QI	21	36506666	36528302	7	1
TCGA-BR-A4QI	21	36531894	46677045	2	0
TCGA-BR-A4QI	22	15294545	19158662	2	0
TCGA-BR-A4QI	22	19159911	22044272	4	0
TCGA-BR-A4QI	22	22044328	37391285	2	0
TCGA-BR-A4QI	22	37393934	38098157	4	0
TCGA-BR-A4QI	22	38104375	50796027	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	251810	30383226	1	0
TCGA-BR-A4QI	X	30384749	31191695	0	0
TCGA-BR-A4QI	X	31192277	47241333	1	0
TCGA-BR-A4QI	X	47241799	48219502	4	0
TCGA-BR-A4QI	X	48223331	55341829	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	55342406	55760088	6	0
TCGA-BR-A4QI	X	55763228	72213959	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	72220179	97677048	3	0
TCGA-BR-A4QI	X	97677551	97819772	4	0
TCGA-BR-A4QI	X	97825346	99109104	3	0
TCGA-BR-A4QI	X	99109123	99594091	0	0
TCGA-BR-A4QI	X	99602984	104889526	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	104898235	105107914	5	1
TCGA-BR-A4QI	X	105113080	105171907	6	1
TCGA-BR-A4QI	X	105177076	106667271	8	0
TCGA-BR-A4QI	X	106668691	111960743	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	111972464	118285598	0	0
TCGA-BR-A4QI	X	118289424	120005283	5	0
TCGA-BR-A4QI	X	120015056	123832142	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	123837554	126724345	6	0
TCGA-BR-A4QI	X	126726147	127086196	0	0
TCGA-BR-A4QI	X	127098078	128998720	6	0
TCGA-BR-A4QI	X	128998874	129116132	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	129116620	129287786	0	0
TCGA-BR-A4QI	X	129294393	130117549	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	130122430	131720471	1	0
TCGA-BR-A4QI	X	131722936	133618337	3	0
TCGA-BR-A4QI	X	133628906	133649405	10	1
TCGA-BR-A4QI	X	133651884	134657962	5	0
TCGA-BR-A4QI	X	134663219	141694289	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	141694897	142593100	0	0
TCGA-BR-A4QI	X	142595020	143666957	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	143668395	145211230	0	0
TCGA-BR-A4QI	X	145212680	147300610	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	147303543	148059958	0	0
TCGA-BR-A4QI	X	148068597	148643869	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	148644207	148860550	0	0
TCGA-BR-A4QI	X	148862603	152648718	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	152649545	156004181	3	0
